实验室以合作申请课题，联合培养博士、博士后，积极开展合作研究，接受进修人员，提供实验条件等方式向全国各院、校、所、CDC 等实验室开放。实验室通过共同申请国际合作课题，积极参与建立具有国际水平的技术平台，不定期邀请国外著名学者短期工作或讲学；举办国际性学术会议；派出优秀青年科技人员，尤其是优秀的临床青年医师，带任务到国外知名实验室短期工作，和国外著名科学家或实验室建立长期合作关系（包括提供实验室和人员、经费）等多种方式，学习先进技术，培养科研和临床工作都优秀的人才参与国际竞争，走向国际前沿。
1、在部门实验室的基础上，进一步加大开放力度
2002～2006 年，本实验室已经面向全国实施开放课题研究项目，已有 23项开放课题得以完成和正在进行。
今后预期每年可从实验室运行经费中拨出 100 万元作为开放专项基金，设置开放研究课题，采用国内外公开招标的方式，吸引优秀科研人才和科研项目进入实验室，促进、提升实验室的科研产出能力、可持续发展和创新能力。
2、建成具有国际水平的传染病研究中心和高层次人才培养基地
培养基地将成为国家组织传染病高水平基础研究和应用基础研究、聚集和培养优秀科学家、开展学术交流的重要平台。面向国内外科研单位和大专院校开放，定期提供国内外传染病学研究趋向和项目指南。在国内外招标客座研究人员开展传染病学前沿领域的方水平研究；提供依托单位内其他实验中心(分子生物实验中心、机能中心、形态中心、药物信息学研究所等)的研究设备以及临床研究基地等方便条件。
本实验室现可提供进行下列研究工作的研究条件：
（1）  分子生物学实验室         （7）  感染微生态实验室
（2）  细菌实验室                     （8）  细胞生物学实验室
（3）  免疫实验室                     （9）  实验动物中心
（4）  基因组学实验室             （10） 生物药物信息学实验室
（5）  蛋白质组学实验室         （11） 器官组织工程学实验室
（6）  代谢组学实验室             （12） P3 实验室
3、开放交流
为了充分与国内外相关研究机构实现优势互补，并实现新兴学科的交互融合，实验室在对外合作上将出台一系列实质性的举措。不仅包括与国内和国际科研院所的合作，还包括与相关企业的合作。
（1） 在国际合作方面，实验室将寻求与国际最著名的科研机构实行全方位的实质性的合作。拟建的国家重点实验室将在以往合作经验的基础上，进一步扩展到多方位的合作，包括多个国际最著名的研究机构。通过这些措施，可望在5年内使实验室的科研水平在高起点上有一个腾飞。实验室还将积极参加国际多中心的、大型的科研合作或攻关，并通过这样的合作，提升实验室的知名度和科研能力。
（2） 在国内，实验室将充分利用国内大型研究平台，进行全方位的合作，使实验室的研究水平能够在整体层面上得以发展。
（3） 加强和相关企业的合作与研发，积极寻找国内外知名企业，实行强强联合，利用企业的雄厚经济实力和生产能力，经营管理能力，建立先少量投入，优先转让的机制，把科研成果迅速转化为生产力，并取得显著的社会效益。
 
与英国帝国理工大学进行科研协作                 与日本岗山大学进行科研协作
 

 在国外访问研究